Dana Otsus tahun anggaran 2003 mencapai sebesar Rp1,53 triliun yang dialokasikan dengan pembagian 60% untuk Provinsi dan 40% untuk 28 Kabupaten/Kota se Provinsi Papua.
60 persen dana otsus bagian provinsi yang mencapai sebesar Rp923.736.000.000 dialokasikan pada berbagai program dan kegiatan strategis daerah yang dilaksanakan oleh SKPD Provinsi Papua
Sebesar 40 persen dana otsus bagian 28 kabupaten/kota mencapai sebesar Rp615.824.000.000 berupa:
Sharing Dana OTSUS Papua antara Provinsi Papua dan Kabupaten / Kota
Bagian Dana OTSUS untuk Kabupaten / Kota se Provinsi Papua Tahun Anggaran 2003